牧野の公開用日誌

つっても、非公開のを別につけているわけではない。

Copyright 1999- Jun Makino

当面の予定

• 2006/10/xx UP 〆切 仮題「重力多体系と専用計算機」
• 2009/10/27 GLIF 2009 牧 野の発表は 12-12:30 とのこと。これ発表してから日本に戻ってこれるかな？
• 2009/11/2 13:30 なんか講習会@大セミナー室
• 2009/11/4 本郷専攻会議
• 2009/11/6 CfCA 定期点検
• 2009/11/6 14 SL MS Yan Xu
• 2009/11/7 三鷹全体停電
• 2009/11/9 灘33なにか
• 2009/11/9 13 理研
• 2009/11/10 13:30 Proofpoint 来訪
• 2009/11/13 14:30 NC 定例
• 2009/11/13 総研大博士予備審査
• 2009/11/20 午後 Proofpoint 来訪こっちに移動？
• 2009/11/27 13:30 防災委員会@第二会議室
• 2009/11/30-12/2 Accelerator-based Computing and Manycore Manycore and Accelerator-based Computing for Physics and Astronomy Applications
• 2009/12/7-9 プロジェクトウィーク
• 2009/12/15-18 岡崎何か 牧野が話すのは 12/16 16:30-18:00 その後懇親会
• 2009/12/20-22 理論懇シンポジウム？
• 2009/12/24-25 階層と全体何か
• 2010/1/12-13 CfCA UM
• 2010/2/4 本郷専攻会議・修士論文発表会
• 2010/2/5 本郷専攻会議・修士論文発表会
• 2010/2/9 13:30 本郷専攻会議
• 2010/2/22-26 総研大アジア冬の学校
• 2010/5/31-6/4 IAU 270 Computational Star Formation @バルセロナ
• 2010/8/30-9/3 MODEST 10@北京 また夏に北京か、、、

• 月曜 11 理論その他連絡会 (幹事会のあったあとの週)
• 月曜 13- 銀河形成ゼミ
• 月曜 16:30- 東大の講義
• 水曜 午前 総研大セミナー
• 水曜 13:20- 理論部コロキウム
• 木曜 10-12? CfCA 定例
• 木曜 14:30-16:30 駒場藤垣セミナー 4/23,5/7,5/21,6/4,6/25,7/9
• 木曜 23-24 Stellar Dynamics in a Virtual UniverseSLURL
• 金曜 午前(原則) 研究室セミナー
• 金曜 17-18? 研究室輪読セミナー
• どこ？銀河形成ゼミ
• 土曜 26-27 Dr. Knop Talks Astronomy (Popular Talk) SLURL

2009/10/31

• あ、どもです＞ずーっと西のほう(もう戻ってきた？まだ？) MPICH2 だとできるかも、ということね。まあ、実際に並列で性能が出るよ うなアプリケーションは HPL ほどネットワークバンド幅を要求しない、と いうことでございます。もちろん、主記憶が小さいせいとかそういう話はある。
• しかし、nested section を作ると実行時に落ちる、、、えーん。 MPI のせいかと思ったらそうでなくて、実行部がからっぽでも nested section になってるだけで落ちてくれる、、、 nested にしないで lock と共有変数を 使うか、、、

• 2009/10/30 (にしてもらったり)岡崎何か原稿〆切
  まだおわってない。おわったことにした(26:25)。
• 2009/10/30 13 小南さん
  論文改訂打ち合わせ。なんか一杯仕事増やしてすみません。
• 2009/10/30 15 eASIC
  スケジュール他。
• 2009/10/30 総研大D予備審査論文提出〆切
  こっちは無事提出。お疲れさま＞K君

• 午前中は定例。この段階では特に問題はなかった。
• が、午後になって、明日〆切の書類のうち、形式的には私の責任か もしれないけど本当は違うはずなところに全く手がついてないことが判明。 文部科学省にいく前にとりあえず私でないほうの責任者な人々に連絡。
• 2009/10/29 17 文部科学省
  この面子なら杉本先生もいてよいような気がするが、やはりそうすると大変 なことになると思われているのかしら？

• 2009/10/28 押野君総研大コロキウム
• 2009/10/28 16 財務
• 古在さん文化功労章。おめでとうございます、はいいとして、解説記事を私がというのはいくらなんでもあ りえんだろう＞某君。本郷での談話会では私が紹介したけどさ。

• GLIF 2009 私の話は午前の最後。座長からのコメントは「ネットワー クがリミットになってないのはよい」まあ、その、それは、チューニングした のと、元々ちゃんとチューニングすれば問題にならないようなアプリケーショ ンを選んだからでございます。
• 会場のブレックファーストはコーヒーが殆ど味がしないほど薄いうえに パンがダンキンドーナツしかなかった。これはかなり点数が低いといえよう。
• んで、受け付けにいったら私の名札がなかった。次の休憩の時に名札はもらったが、 それ以外の研究会の資料とか全部もらいそこねた。 それはいいんだけど無 線LAN の WEP key とかも。これだけ聞いて、紙切れもらう。
• 昼は会場のレストランで。産総研な皆様と一緒に。「ネットワーク実験 は一人すごくわがままな人がいないと上手くいかない」とはなかなかそのとお りとしかいいようがない。
• 昼のあと会場の前でタクシーひろって空港行きのバスが出るところに。 Government Complex というのがなかなか通じなくて、Gimpo Airport といった らなにかを了解したようであった。何を了解したのかいま一つ不明だったけど、 ちゃんとバス停に。こっちは皆チケットを買っているようだったので買う。無 事に 14:25 のバスに乗れた。運転手さんが昨日と同じ人のような気がする。
• で、 10/30 が(ものすごく延ばした)〆切の原稿をせこせこ書く。渡辺様 本当にありがとうございます。
• しかし(運転手さんが同じせいか、それとも韓国のバス一般がこうなのか 不明だが)やたら揺れるのであまり難しいことは無理であった。しょうがない ので寝る。
• 行きは3時間以上かかった気がするが、帰りは2時間半ばかりで Gimpo 空 港に。3時間前についてしまう。で、今度はせこせこ原稿書き。
• 帰りの飛行機は ANA の機材な気が。
• 韓国・中国にいくとなんとなく落ち着けない、、、まあ、単に英語が通 じないからか。

• GLIF 2009 とかいうものに出席のため羽田に。Daejeon だったかな、 韓国のどこかにあるらしいところにソウルの Ginpo 空港経由で向かうらしい。
• ということで朝9時に家をでて車転がして羽田へ。C1 の辺りはちょっと 混雑しているがたいしたことなく空港に着く。国際線使う時には駐車場割 引があるとのことなので P5 にいくが満車。P4 において、国際線ターミナル とは反対側の管理事務所で割引券をもらう。

  羽田便は空港近いし駐車場も安くて大変素晴らしい。国際線ターミナルはなん だかいきなり羽田の中にもうひとつ地方空港があるような不思議な雰囲気。で、 チェックインしてからACコンセントを探すわけだが、これが見つからない。しょ うがないので出国手続きをする。で、壁コンセントを捜して放浪する。私が乗 る便が出る Gate 3 から一番遠いところまでいくと電動マッサージチェアがあっ て、その横に空いてるコンセントがあった。

• で、今日は確定調査。私がいないことを承知の上で事務が日程を決めた ので、私のところに緊急に連絡とかはない「はず」なんだけどもちろんそんな ことはなくてメイルや電話が、、、というのはいいんだけど、電話がかかって きた某君の携帯に折り返し電話したら「こちらは au お留守番電話センターで す」が出るのはどういうわけだよ？
• でもって、事務がまだ片付いていないような気がするけどボーディング。 フライトはアシアナ航空。HIS から送ってきた資料には ANA の機材と書いて あったけどそんなことはなくてアシアナ航空のと思われる A330。ちゃんと日 本海が East Sea になっているのに感心する。機内食は結構レベルが高い。 (まあ、私が普段使っている NW や UA やコンチネンタルに比べて、という話だ)
• 空港についたらバス乗り場を捜す。国際線ターミナルにもくると資料に は書いてあって多分それで問題なかったはずだが、インフォメーションで聞い たら循環シャトルで国内線ターミナルにいって7番、と言われたのでそっちに。 バスは1時間に一本(毎時00分)だが、割合タイミングが良くて 15分待ちくらい。 チケットを買うとか特になくて、乗ってから運転手さんが料金集めに回るシス テム。
• バスの運転はなんだかあらっぽいような、、、これ書いてたら気分が悪 くなってきた、、、明日の発表の準備もしないといけないわけだが、、、
• ああああああ、ホテルについて荷物をひっくり返しても変換プラグがな いぞ、、、とりあえずフロントにいって借りる。電池は2本もってきたから、 両方とも充電すれば明日1日ほぼもつはずである。
• で、ホテルでのたのたしているとなんだが爆発音が、、、というか、花 火だったらしい。 90th National Sports Festivalなのかな？ TV でなんかセレモニーの映像を流していて、TVの花火の音がして数秒後に外で音がする。電波は速い。
• いや、それはやはり、今日問い合わせた、ということによって、今日レ ポートが届いた、という現実が選択されたのだ、と思うことにしましょう。
• シャトルバスは8時であると。
• 明日の帰りの飛行機は8時発なので、空港に6時に着くことを要請する と、、、バスの待ち時間は、、、 ここにタイムテーブルがある。 14:25 のバスに乗るのが目標と。これ来年のタイムテーブルかな？今年の違っ たらどうしよう ？ 2008 年にもこれだったらしいので大丈夫かな。
• 坂本君は2週間前にここにきてた、というか、 IAC というものがここであったのね。

• 某所の某機械で OpenMPI をローカルにインストール。ファイルサーバ が確かに遅いわね。こういうのを1年以上放置しているセンター運用は、、、っ て私のせいか？
• zil_disable がなんたら、みたいな。
• 明日は12時の飛行機で、、、どこいくんだっけ？
• で、12月には岡崎で何か、というのがあるけど、これは機構内だよな。 謝金がどうたらと書いてあったけど、それはちょっと難しいのではないかいな。

• 2009/10/24 国立天文台特別公開
• 特別公開。お客様と雑談したり 4D 見にきた姉+姪と雑談したりする。
• mpich は thread safe でないというので目の前が暗くなったが、 OpenMPI は対応しててちゃんと動く。なんだかすごい。

• 午前中は研究室セミナー。とりあえずここには感想は書かない、みた いな。
• 2009/10/23 14 SS研何か。すみません、予定表に書くの忘れてまし た
  というわけで15:30 で脱出。F で次世代アプリケーションやってる人にN君の 連絡先を聞かれる。 大人気である。マネジメントする会社を作ったらボロ儲 けできないかとちょっと考えたが、まあ、無理だわね。
• OpenMP 使った並列化 (sections とか、、、)も一応書いた。
• 2009/10/23 17 何か。
• 博士論文予備審査用何かその2に赤をいれる。
• 某報告書用補足資料原案をみて怒り心頭、みたいな。

• 2009/10/22 13:30 防災委員会@第二会議室
• 2009/10/22 17 理論スタッフ会議
• 会議な日。午前中は CfCA 定例、13:30-16:00 防災委員会、17-19 拡大理論スタッフ会議。
• L(DU) の順でなくて (LD)U の順に計算する変態アルゴリズムも実装終了。ふう。 後退代入をこれ用に書き直さないといけないが、これは LU 分解の定義を満た しているのかね？

• 博士論文予備審査用何かを眺める。
• 【 2009年10月20日 文科省の科学技術関係削減額は1,965億円 】 これは「補正予算の」削減なんだけど、 GCOE とかそういうのも、、、 という噂もちらほら。
• 大学とかの建物はほぼ計画通りのようで。
• もちろん報告書も計画書も出してるわけで、 JST の都合？評価が でてからまとめて載せるのかな？
• 2009/10/21 18 4D 何か@どこか
• 非同期化のためのルーチン分割はできたと。

• Mew がなんか使いにくくなっていると思ったら、 .mew-folder-alist がほぼ空になっていた。何故だ？よくわからないので適当に新しく作る。

     ls | awk '{print "(\"+" $1 "\"" " . \"" $1 "\")"}' | tr -d "/" > .mew-folder-alist
  

  としてから最初と最後に括弧をつける。本当はディレクトリであるものだけを リストすればよいわけだが、上の例だと本当は

  ls -F | grep "/" | tr -d "/" | awk '{print "(\"+" $1 "\"" " . \"" $1 "\")"}'  > .mew-folder-alist
  

  か。私の環境は ls が ls -F になってる。
• 昨日1時まで虫取りしてたら今日は事務仕事が一杯、、、しかも眠い、、、
• 論文原稿1つ処理。明日もうひとつしないと、、、コーディングの時間がない、、、

• lookahead 以前のところにバグというか、、、修正。
• 2009/10/19 14 入札説明会@大会議室
  調達不調にならないように、、、

• lookahead も実装。あとは通信の非同期化ができれば完成かな。ふう。

• 散髪。
• 「次世代スーパーコンピューティング・シンポジウム2009」の報告ページというもの。

• セミナーは押野君、石山君。
• 論文改訂もしないと。
• 転置書いた。デバッグ中。列位置の計算がまだおかしいな。

• その辺から発掘した機械に Windows XP をいれる。ハードディスクが Linux がはいってるものしかなかったんだけど、それをそのままつけると DVD いれてそっちからブートしても setup にいかない。パーテッション消し たらいったんだけど、そういうものなの？
• 再帰版 DTRSM は実装。Gustavson もしないと。
• Gustavson もした。あとは転置か。

• 非再帰でまだ行列積にもなってないけど一応ブロック化版動作。ふむ。
• An Inconvenient Truth: Intel Larrabee story revealed LRB はまあ 2011-2012 ですかね的な記事。
• で、 NV は次世代任天堂に採用と。GT300 がどうなろうと倒産はないということかな。
• あ、、、 X8DTG-QF って単体販売してないっぽいんだよね、、、
• 非再帰だけど行列積。

• 2009/10/13 10 来客
• 2009/10/13 11 連絡会@輪講室
• 2009/10/13 15:30 NC 定例
• ブロック化版デバッグ。

• CF-R8(09夏モデル) を買うという某氏に付き合って秋葉原。11万切るのか、、、

• MPI なデバッグ。ふむ、一応並列版(といってもまだメモリレイアウト 以外はブロック化できてないんだけどね) 動いたかな。

• 終日プログラム書き。

• なにしてたっけ？午前中はセミナー、午後は、、、事務処理、松井君 の結果を色々議論、小池君と議論、それくらい？
• Nvidia snubs Intel. nForce 200 搭載マザーがなくなると困るなあ、、、 P6T6, Eclipse Plus, あとどこだっけ?
• Nehalem-EP 用は相変わらず使えそうなマザーボードはないと。
• H8DAi+-F って素晴らしく魅力的な、、、、Dual SR5690 で PCIe 2.0 が本当に 4x x16 あるんだな。なんに使うかというと こんなのであると。あー、Nehalem-EP でも こんなのもあるのか。でも、こっちは x8 か。駄目である。

• 2009/10/7-8 理研スパコンシンポジウム。牧野は8日午前中に何か
• 私は暴れてないと思う。平木さんは知らないけど。まあ、当人はそう思う、というだけか？
• とはいえ、なんか分科会では私が娯楽を提供する係だったのではないかという気が。
• 最後の総合討論では、パネル(分科会責任者) 6人のうちの3人が東大物理 出身だった。計算科学というのは要するにそういう分野である。
• 後の懇親会で Thomas Lippert につかまって、球状星団のダークマターがこうとか MOND が ああとかいう話を聞かれる。
• Particle physicist な立場からすると SUSY に基づく CDM 粒子なんても のよりは MOND のほうがまだ受け入れやすいんだそうな。まあ、近くから見る とどれくらいいい加減かよくわかるということであろう。
• Combes 先生とかが MOND でのバー不安定とかそういう研究をしているの ね。その結果を見る限り MOND はアウトだと思うが。

• 総研大セミナー。面白かったが、あれは赤外の絵だ、とか私に言われるのは問題なような気もしなくもないような。
• かわいくん本人？
• 某調達仕様書案書いた。ふう。
• 矢原さんのブログにちょっと前にカンボジアの人口ピラミッドの話があっ たので、日本のはどうかと思ったら こんな感じだそうで。半減期 35年くらい。
• Dally 先生インタビュー。
• 最先端。どうなることやら。

  政府・与党は今年度補正予算見直しの一環として、総額２７００億円の研究費を３０人の研究者に分配する「最先端研究開発支援プログラム」を７００億円減額し、支給対象者も大幅に増やす方針を決めた。現在の支給対象者３０人は、１人あたりの支給額が平均で３分の１程度に減る。

  まあ、これにどうやって90億も？というのが結構なかったわけではないので、 妥当な方針だとは思うけど。

• 2009/10/6 INTEL COMPILER 講習会 13ー15
  講習会の後で講師の方とお話した。
• なんとか論文2本処理。あああ、事務仕事も他のいろんなことも全部 25 時になってもなにもできてないぞ、、、
• 東のほうに送ったメイルがエラーになった。 10240000 バイトがリミット とのこと。いまどきもうちょっと大きくてもいいじゃん。
• 太陽系「惑星Ｘ」発見するぞ！探査計画始動。PS1 のはもちろん別に惑星 Xのための計画ではないと。まあ、深いサーベイして TNO が沢山見つかればそ れはそれで大きな成果になると思う。
• 手が速いね、、、ということは、 (1,-1) とか (1,1) をいれるとちょっ と改善するのかな？

• 午前中はメイル処理。
• 午後まずちょっと私用で都内に。
• 夕方三鷹に戻る。で、斎藤君、松井君と議論、関口君と雑談？それから小 池君と相談、それから岩澤君と議論、とかしてたら日付変わりそうになった。
• A and A のレフェリー依頼。一週間ねかせてから返事をしたら既に別の 人に回したとのこと。大変素晴らしい。みんなそういう人ならいいんだけ と、、、
• 周期境界なら密度分布をフーリエ級数展開というかk=1 の項だけ計 算して位相求めればよいのでは？まあ、なんとなく、気泡がないところのゆら ぎが気泡の位置の推定に影響するのは美しくないけど。気泡の形がわかってる なら密度分布と気泡の形状を表す関数との相関が極小になる位置を使うとか。

• どうせ2名のうちの1名は私であろう。もう一人ってだれ？
• PM というか charge assignmnent の並列化とかは例えば 石黒 さんのこれとか。プラズマの人はほぼ一様分布で粒子数がメッシュ数より ずっと多い時のことしか考えてないので、宇宙向けでこれでいいかどうか知ら んけど。まあ、宇宙向けならどうせ TreePM とかだから、PM のところをそん なに速くする必要自体がないという話も。
• 並列ソートすると計算量のオーダーが上がってしまうので、そうでなく て O(N) で、粒子がどのメッシュにいるか決めたい、しかもちゃんとハードウェ アの性能も出したい、とすると、阪大の西原先生が提案していた、 ベクトル化できないループを無理矢理ベクトル実行して、間違ってるところを あとで修正する、というのがハードウェアの動作のしかたによっては使える かも。 GPU は駄目そうな気がするけど。 始めから分散メモリ並列みたいなものだと思って、主記憶上でメモリ無駄に 使ってもいいからメッシュ(ないしもうちょっと大きなブロック)毎に 粒子を分割しておきたいね。まあ、それは並列ソートでは、といわれたらそう か。でも、せいぜい隣にしか移動しないので1ステップでの計算量は O(N)のは ず。
• 論文もうひとつ処理。
• また風邪引いた。

• 院生棟のローカルネットワークが死んだとのメイルがきたので見にい く。結局、ファイルサーバの一つが不思議な死に方をしてネットワーク全体を 巻き添えにしていた模様。

  Oct  3 04:36:48 localhost kernel: NETDEV WATCHDOG: eth0: transmit timed out
  Oct  3 04:36:48 localhost kernel: eth0: Got tx_timeout. irq: 00000000
  Oct  3 04:36:48 localhost kernel: eth0: Ring at 3763e000: next 1219448186 nic 1219447931
  Oct  3 04:36:48 localhost kernel: eth0: Dumping tx registers
  

  この辺 によると MPC55 用の RHEL/CentOS のカーネルかドライバの問題という感じだ が、うーん、2年くらい使ってて初めておきたというのが。
• アスペルガー症候群。良い本のような気がする。

• FPGA の分も数にいれろというのはもっともだが、 GRAPE-DR チップの 半分以下だと思う。値段はさらにずっと下、、、 Arria GX の 50なの。
• 論文草稿1つ処理。投稿まではまだもうちょっと。残ってるのは K, T, I と。すみません、 T をちょっと先にするかも。
• Korea気象庁　2010年にCrayの600Tflops機を導入

  多分、AMDの6coreか、Intelの8coreを使った開発中の新システムを設置するものと考えられている。

  2010H2 なら AMD なら Magny Cours 12 コアになるから、Tflops 単価が 4コ アの時の 1/3 になると思うのが普通なのに、 AMD 6 コアという無根拠な推測を「考えられ ている」とか書くのはどんなものかなあ。で、まあ、日本の調達は高い、とい うのはそうだけど、それを、来年後半に入るシステムと今年前半にはいったシ ステムの比較でやるとなんだか××な感じ。少なくとも JAIST のを 「前述のとおり、この先端大学院大のCrayのケースも米国ないしはKoreaでのCrayの単価から は飛び抜けて高い」とかいうのは、、、しかも、その「前述」は 「Tflops単価が2分の１程度というのであればさほど驚きは無いが、「3分の1 以下」となると、若干驚きである。」なので、あれ？みたいな。「飛び抜けて高い」は Cray Japan 及び JAIST にあまりに失礼であろう。
• あ、ごめんなさい、50じゃなくて60だ。なんで勘違いしたんだろう？

• 1119375
• 6ヶ月間外人お客さんがくる。皆様よろしく、みたいな。
• ああああああ、月末に研究会があるのを忘れてた。
• 石山君論文本当にアクセプト。わーい。
• Fermi は本当に こんなも のなんだ。倍精度でクロック当り 256FMA という演算数は GRAPE-DR と同 じで、トランジスタ数は8倍、クロックは？だが、倍精度性能が GTX285 の8倍 という(あまり信用できない)情報を信用するなら 1.3GHz 程度で GRAPE-DR の3倍前後、そういうわけでトランジスタ8倍使ってクロック3倍で 性能は3倍なんだなあ、、、それでも値段はトランジスタ 8 倍使ってるほうが 安いというのが悲しいところ。
• どうでもいいが上の4gamer.net の写真は Mr. Spock にしか見えない。
• 2009/10/1 19 何か。某論文アクセプトおいわい。(石山君のは違う)

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